第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档继续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善良，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的朋友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。
满族少女叶赫那拉玉兰（刘雪华 饰）天资聪慧，心高气傲，一心想要摆脱贫穷的生活挤入上层社会。某日，她于雪地之中邂逅了微服出访的六皇子奕欣（伍卫国 饰），而奕欣又和一直爱慕玉兰的李乐天（刘纬民 饰）结为了好友，三人之间关系十分复杂。 奕欣突然接到急诏回宫不辞而别，这让玉兰感到十分心痛。玉兰决定参加秀女选拔，而奕欣则在宫廷争斗之中落败，被继位的咸丰帝（黄浩义 饰）封为恭亲王。冰雪聪明的玉兰在宫中步步高升，最终被封为懿妃，却受到了咸丰帝的提防，权力遭到架空。同治帝登基后，封玉兰为西宫太后慈禧，而在此期间，恭亲王一直默默守候在玉兰的背后，助玉兰最终登上了权力的顶峰。
朱承开（温兆伦 饰）与王一正（吴启华 饰）是相识多年的同事兼好友，个性和脾气迥然不同的两人曾经联手破获过不少的难解奇案。朱承开后因为性格火爆与同事产生龃龉辞去了警察的职位，转而成为了保安公司的调查科经理。 事业上颇为不顺的朱承开在感情上也经历了滑铁卢，他和女友林茜（宣萱 饰）之间一直分分合合没有定数。与此同时，朱承开的前女友宋洛文（莫可欣 饰）亦出现在了朱承开的面前，本以为能够和宋洛文重修旧好的朱承开在经历了种种意外事件之后才发现，在宋洛文的背后，隐藏了许多的秘密，而他和林茜亦被卷入了危险的凶杀案之中难以自拔。
《家家有本難唸的經》是一齣講述家庭關係的倫理單元劇，十五集十五個故事，將父母與子女，爺與孫，夫與妻各種關係的悲歡離合展示出來。 如「教子無方」中兒子因不滿母親教導而離家出走；「子承父業」中的倫的木廠業務已上軌道，希望兒子拔繼承木廠業務，但拔無意承父業，引起兩代矛盾；「有子萬事足」中占母得知媳婦有孕，高興非常。她有多個女兒，所以希望阿奇生個男孩。奇母卻喜歡女兒生女孩，兩親家因而爭吵起來。各種故事從不同角度看家庭關係，結局每每發人深省。
欧阳梓聪（洪水城 饰）和朱明明（黄翠如 饰）相恋多年，感情一直十分要好。年岁渐长，明明渴望着能够和恋人携手步入婚姻的殿堂，但欧阳梓聪对结婚却充满了顾虑，迟迟不愿意进一步发展两人的关系。一场意外中，以为自己命不久矣的欧阳梓聪向朱明明承诺如果两人都能平安无事便马上结婚，结果可想而知，欧阳梓聪和朱明明就在这样一种误打误撞半推半就的情况下踏入了围城。 让朱明明没有想到的是，结婚没多久，自己便升职成为了施露嘉（陈炜 饰）助理，而施露嘉失败的婚姻让她对属下的感情生活十分反感。更糟的是，欧阳梓聪在阴差阳错之下成为了朱明明的同事，为了保住职位，两人就此开始了“隐婚”生活。
